|
بررسی امکان کلونینگ قطعه آنتی‌ژنیک پیش‌گویی شده توسط نرم‌افزارهای بیوانفورماتیکی آنزیم هیالورونیداز استرپتوکوکوس پایوژن
|
صفیه صوفیان   ، شبنم صدوق‌عباسیان ، علی‌رضا ژاپونی‌نژاد ، حمید ابطحی |
|
|
|
چکیده: (4653 مشاهده) |
| سابقه و هدف: از مشکلات جدی در
تولید آنزیم هیالورونیداز استرپتوکوکوس پایوژنز به صورت نوترکیب، وزن مولکولی بالای
این پروتئین می‌باشد. هدف از انجام این مطالعه استفاده از نرم‌افزارهای بیوانفورماتیکی
جهت پیش‌بینی نواحی با بیش‌ترین
خاصیت آنتی‌ژنیک در پروتئین هیالورونیداز، پیش‌گویی ساختار قطعه مورد نظر و ارزیابی
کلونینگ آن در وکتور pTZ57R/T می‌باشد. مواد
و روش‌ها: ابتدا جهت به‌دست آوردن توالی مورد توافق در تمامی توالی‌های
آمینو اسیدی آنزیم هیالورونیداز، هم‌ترازی چند‌گانه با استفاده از نرم‌افزار MegAlign
و روش Clustal
W صورت پذیرفت.
آنالیز BlASP صورت پذیرفت. نواحی آنتی‌ژنیک با استفاده از
نرم‌افزارهای آنلاین ABCpred، BcePred و Emboss تعیین گردید. ساختمان سه بعدی نواحی آنتی‌ژنیک تعیین شده، با
استفاده از نرم‌افزار TASERI پیش‌گویی شد و با استفاده از نرم‌افزار Swiss-PDB Viewer بررسی گردید. در نهایت قطعه پیش‌بینی شده در وکتور pTZ57R/T وارد گردید. یافته‌ها: توالی مورد توافق به‌دست آمده دارای 868 آمینو اسید بود که
توالی امینو اسیدی 279 تا 773 به عنوان منطقه با آنتی‌ژنیک بالا به منظور کوتاه
کردن توالی با استفاده از نرم‌افزارهای آنلاین انتخاب شد. در نهایت نتایج نشان داد
که بخش‌های آنتی‌ژنیک ژن هیالورونیداز در وکتور pTZ57R/T کلون شده است. نتیجه‌گیری: توالی مورد توافق به‌دست آمده دارای 868 آمینو
اسید بود که توالی امینو اسیدی 279 تا 773 به عنوان منطقه با آنتی‌ژنیک بالا به
منظور کوتاه کردن توالی با استفاده از نرم‌افزارهای آنلاین انتخاب شد. در نهایت
نتایج نشان داد که بخش‌های آنتی‌ژنیک ژن هیالورونیداز در وکتور pTZ57R/T کلون شده است |
|
| واژه‌های کلیدی: آنزیم هیالورونیداز، نواحی آنتی‌ژنیک، کلونینگ |
|
|
متن کامل [PDF 790 kb]
(1335 دریافت)
|
نوع مطالعه: پژوهشي |
موضوع مقاله:
عمومى
دریافت: 1392/11/12 | پذیرش: 1394/2/9 | انتشار: 1394/7/2
|
|
|
|
|
|
|
| ارسال پیام به نویسنده مسئول |
|
|
|
| ارسال نظر درباره این مقاله |
|
|
|
