[صفحه اصلی ]   [Archive] [ English ]  
:: صفحه اصلي :: درباره نشريه :: آخرين شماره :: تمام شماره‌ها :: جستجو :: ثبت نام :: ارسال مقاله :: تماس با ما ::
:: جلد 20، شماره 1 - ( زمستان 1396 ) ::
جلد 20 شماره 1 صفحات 81-88 برگشت به فهرست نسخه ها
آنالیز شبکه برهمکنش پروتئین - پروتئین بر اساس ژن‌های تغییر بیان یافته در مایع مغزی نخاعی برای بیماری مالتیپل اسکلروزیس
ناهید صفری علی قیارلو، مصطفی رضایی طاویرانی* ، محمد تقی زاده، سید محمد طباطبائی، سعید نمکی
چکیده:   (1042 مشاهده)
هدف: ام.اس شایع‌ترین بیماری تخریب میلین سیستم عصبی مرکزی است. روش‌های جدید، برای فهم بهتر بیماری‌زایی و معرفی اهداف دارویی جدید ضروری می‌باشند. هدف این مطالعه، استفاده از روش شبکه زیستی به منظور شناسایی نشانگرهای کلیدی جدید درگیر در بیماری‌زایی ام.اس بود.
مواد و روش‌ها: در این مطالعه، پروفایل بیان ژن مایع مغزی نخاعی مربوط به 26 بیمار تازه مبتلا شده به ام.اس و 18 فرد کنترل از پایگاه داده Array Express گرفته و آنالیز شد. ژن‌های متفاوت بیان شده با داده‌های برهمکنش پروتئین-پروتئین تلفیق و زیرشبکه برهمکنش پروتئین- پروتئین ساخته شد. ویژگی‌های توپولوژیکی شبکه حاصل توسط نرم‌افزار cytoscape مورد آنالیز قرار گرفت.
یافته‌ها: با آنالیز پروفایل بیان ژن، 3062 ژن متفاوت بیان شده (0/05FDR<) در مایع مغزی نخاعی بیماران ام.اس در مقایسه با افراد کنترل مشخص شدند که 1080 ژن افزایش بیان و 1981 ژن کاهش بیان داشتند. با ادغام ژن‌های متفاوت بیان شده و داده‌های برهمکنش پروتئین- پروتئین زیرشبکه‌ای با 1440 رأس و 3500 یال ساخته شد. پس از آنالیز ویژگی‌های توپولوژیکی زیرشبکه، پنج ژن جدید که مقادیر بالای پارامترهای مرکزیت را داشتند، به عنوان نشانگرهای کاندید معرفی شدند. این نشانگرها در مسیرهای زیستی نظیر تنظیم دینامیک اسکلت سلولی، چرخه سلولی، اسپلایسوزوم نقش دارند. با بررسی متون، ارتباط نشانگرها در بیماری‌زایی ام.اس تأیید شد.
نتیجه‌گیری: بنابراین، آنالیزهای بر پایه شبکه می‌تواند نشانگرهایی را معرفی کند که بتوان آن‌ها را به عنوان اهداف دارویی بالقوه برای ام.اس مورد بررسی بیشتری قرار داد.
واژه‌های کلیدی: : ام.اس، پروفایل بیان ژن، نقشه‌های برهمکنش پروتئین-پروتئین، ویژگی‌های توپولوژیکی
متن کامل [PDF 767 kb]   (235 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشي | موضوع مقاله: عمومى
دریافت: ۱۳۹۵/۸/۴ | پذیرش: ۱۳۹۶/۸/۶ | انتشار: ۱۳۹۶/۱۰/۱۱
ارسال پیام به نویسنده مسئول

ارسال نظر درباره این مقاله
نام کاربری یا پست الکترونیک شما:

CAPTCHA code


XML   English Abstract   Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Safari-Alighiarloo N, Rezaei-Tavirani M, Taghizadeh M, Tabatabaei S M, Namaki S. Analysis of protein-protein interactions network based on differentially expressed genes in cerebrospinal fluid for multiple sclerosis . koomesh. 2018; 20 (1) :81-88
URL: http://koomeshjournal.semums.ac.ir/article-1-3688-fa.html

صفری علی قیارلو ناهید، رضایی طاویرانی مصطفی، تقی زاده محمد، طباطبائی سید محمد، نمکی سعید. آنالیز شبکه برهمکنش پروتئین - پروتئین بر اساس ژن‌های تغییر بیان یافته در مایع مغزی نخاعی برای بیماری مالتیپل اسکلروزیس . كومش. 1396; 20 (1) :81-88

URL: http://koomeshjournal.semums.ac.ir/article-1-3688-fa.html



جلد 20، شماره 1 - ( زمستان 1396 ) برگشت به فهرست نسخه ها
کومش Koomesh
Persian site map - English site map - Created in 0.05 seconds with 31 queries by YEKTAWEB 3768