:: جلد 25، شماره 5 - ( مهر و آبان 1402، ویژه نامه 5 امین کنگره بین المللی و 26 امین کنگره فیزیولوژی و فارماکولوژی ایران 1402 ) ::
جلد 25 شماره 5 صفحات 140-140 برگشت به فهرست نسخه ها
شبیه سازی داکینگ مولکولی 1-توسیل-1H، 4،2،1- تری‌آزول-5-آمین به عنوان مهارکننده HSV-1
پریسا دهقان ، معصومه طباطبایی ، سید مرتضی سیفتی
چکیده:   (290 مشاهده)
هدف: هرپس سیمپلکس ویروس 1 یکی از اعضای خانواده α-Herpesviridae است که عامل ایجاد ضایعات حلقی- دهانی، تبخال تناسلی و آنسفالیت می‌باشد و ثابت شده‌است که با بیماری خودایمنی مرتبط است. سولفونامیدها، دسته مهمی از ترکیبات دارویی می‌باشند که برای از بین بردن طیف وسیعی از عفونت‌های ویروسی استفاده می‌شوند. این مطالعه با هدف بررسی میل ترکیبی 1-توسیل-1H، 4،2،1 تری‌آزول-5-آمین در برابر تیمیدین کیناز HSV-1 با استفاده از نرم‌افزارAutoDock Vina  انجام شد.
مواد و روش‌ها: 1-توسیل-1H، 4،2،1 تری‌آزول-5-آمین(L) از واکنش 3-آمینو-4،2،1-تری‌آزول و 4-متیل بنزن سولفونیل کلرید در حلال دی‌کلرومتان سنتز تک‌ظرفی و در شرایط رفلاکس به مدت 8 ساعت بدون کاتالیزور سنتز گردید. ساختار کریستالی L با پراش اشعه ایکس تک بلور تعیین شد. مطالعه کریستالوگرافی اشعه ایکس تأیید کرد که L در گروه فضایی P¯1 تری‌کلینیک با دو مولکول در هر سلول متبلور می‌شود. پارامترهای سلول واحد عبارتند از a=6.3903(2)Å، b=11.0236(4)Å و c=15.3312(6)Å. مطالعه حاضر از AutoDock Vina، Discovery Studio visualizer، MGLTools و LigPlot+ برای اتصال و داکینگ مولکولی استفاده کرد. ساختار کریستالوگرافی تیمیدین کیناز HSV-1 (PDB: 2KI5) از بانک داده پروتئین RCSB دریافت گردید. ﺟﺎﻳﮕﺎه اﺗﺼﺎل این پروتئین دارای حجم A3453.534 و مساحت سطح A2262.181 است که توسط CASTp محاسبه گردید.
یافته‌ها: انرژی آزاد اتصال ترکیبL  در بهترین کانفورماسیون با RMSD=0.000 برابر (ΔGbind kcal/mol) 8- بود. اسید آمینه درگیر در ﺟﺎﻳﮕﺎه اﺗﺼﺎل با L، دو رزیدو شامل Thr 101 و Arg 163 است که در تعامل با رسپتور، پیوند هیدروژنی برقرار نمودند.
نتیجه‌گیری: نتایج این پژوهش نشان داد که 1-توسیل-1H، 4،2،1 تری‌آزول-5-آمین می‌تواند به‌عنوان یک ترکیب امیدوارکننده برای توسعه ترکیبات ضد ویروسی مطرح شود.
واژه‌های کلیدی: داکینگ مولکولی، 1-توسیل-1H، 4، 2، 1 تری‌آزول-5-آمین، تیمیدین کیناز HSV-1
متن کامل [PDF 338 kb]   (45 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشي | موضوع مقاله: عمومى
دریافت: 1402/9/18 | پذیرش: 1402/6/1 | انتشار: 1402/6/1


XML   English Abstract   Print



بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.
جلد 25، شماره 5 - ( مهر و آبان 1402، ویژه نامه 5 امین کنگره بین المللی و 26 امین کنگره فیزیولوژی و فارماکولوژی ایران 1402 ) برگشت به فهرست نسخه ها