Koomesh journal
كومش
Koomesh
Medical Sciences
http://koomeshjournal.semums.ac.ir
47
journal47
16087046
10.52547/koomesh
fa
jalali
1395
3
1
gregorian
2016
5
1
17
4
online
1
fulltext
en
بررسی پولیپهای روده بزرگ با استفاده از رزونانس مغناطیسی هسته 1H
Study of colorectal polyps using 1H Nuclear Magnetic Resonance spectroscopy
عمومى
General
پژوهشي
Research
سابقه و هدف: بیماران مبتلا به پولیپ و کولیت اولسروز مستعد ابتلا به سرطان کولورکتال هستند. با توجه به این که در حال حاضر، تشخیص بیماریهای کولورکتال با روشهای تهاجمی مانند کولونوسکوپی و سیگموئیدوسکوپی صورت میگیرد. اخیراً تحقیقاتی برای تشخیص زودهنگام سرطانها از جمله سرطان کولورکتال با استفاده از روش طیف سنجی (1H Nuclear Magnetic Resonance, HNMR) و علم کمومتریکس انجام شده است. در این تحقیق، نتایج طیف حاصل از نمونه HNMR بیماران مبتلا به پولیپ با افراد سالم مقایسه گردید.
مواد و روشها: پس از گرفتن رضایتنامه از 40 فرد مراجعهکننده جهت انجام کولونوسکوپی، نمونه خون گرفته شد. این افراد به مدت 72 ساعت دارای رژیم غذائی مایعات رقیق بودند. پس از جمعآوری نمونههای خون در لولههای هپارینه، پلاسمای خون افراد سالم و بیمار، جهت طیف سنجی HNMR با روش Spin-echo CPMG به دانشگاه صنعتی شریف فرستاده شد. پس از آنالیز اجزا اصلی (Principle Component Analysis) با استفاده از نرمافزار ProMetab، متابولیتهای مختلف با توجه به جابهجایی شیمیایی (Chemical Shift) آنها جدا شد.
یافتهها: با استفاده از نرمافزار ProMetab، 1624 متابولیت برای طیف هر نمونه حاصل شد. در این بررسی متابولیتهای تاثیرگذار با استفاده از نرمافزار پایگاه اطلاعاتی Human Metabolome Data Base بهدست آمد و به منظور بهدست آوردن چرخههای متابولیتی از نرمافزار پایگاه اطلاعاتی Metaboanalyst Data Base استفاده گردید.
نتیجهگیری: متابولیسم چرخهای سنتزامینو اسیل tRNA، نیتروزن، هیستدین، سیانوآمین و تیامین در ایجاد پولیپهای روده حائز اهمیت هستند
Introduction: The patients with polyps and ulcerative colitis diagnosis are more susceptible to colorectal cancer. So far, the diagnosis of colorectal diseases has been dependent on invasive procedures, such as sigmoidoscopy and colonoscopy. However, some recent research has been initiated for early diagnosis of colon cancer by using1H nuclear magnetic resonance (1H NMR) spectroscopy and chemometrics methods. In this study, spectrum results of patients and samples of normal subjects were compared.
Materials and Methods: Participants who referred for colonoscopy (n=40) filled a consent form.They had received liquid diets for last 72 hours. Blood samples were collected in heparinized tubes. Samples were collected from patients who were diagnosed with polyps and also normal subjects. The separated plasma samples were sent for 1HNMR spectroscopy using CPMG Spin-echo methods. The samples were analyzed using ProMetab software, with performance of Principle Component Analysis. The different metabolites were identified by their chemical shifts.
Results: There were 1624 metabolites in each spectrum. Effective metabolites were detected using Human Metabolome Data Base and effective metabolic cycle were determined using metaboanalyst Data Base.
Conclusion: These findings indicated that the metabolism of amino acid tRNA synthase, histidine, cyanoamine and thiamine are the main differentiating metabolic cycles involved in the production of colorectal polyp.
پولیپ روده بزرگ, سرطان کولودکتال, طیف سنجی, کمومتریکس
Colorectal Polyp, Colorectal Cancer, Spectroscopy, Chemometrics
974
980
http://koomeshjournal.semums.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-2488-1&slc_lang=en&sid=1
sedigheh
sadeghi
صدیقه
صارقی
4700319475328460027521
4700319475328460027521
No
Biochemistry Dept., Pasteur Institute of Iran, Tehran, Iran
بخش بیوشیمی، انستیتیو پاستور ایران ، تهران، ایران
ayda
iravani
آیدا
ایروانی
4700319475328460027522
4700319475328460027522
No
Biochemistry Dept., Pasteur Institute of Iran, Tehran, Iran
بخش بیوشیمی، انستیتیو پاستور ایران ، تهران، ایران
mohammad
arjmand
محمد
ارچمند
4700319475328460027523
4700319475328460027523
No
Biochemistry Dept., Pasteur Institute of Iran, Tehran, Iran
بخش بیوشیمی، انستیتیو پاستور ایران ، تهران، ایران
farideh
vahabi
فریده
وهابی
4700319475328460027524
4700319475328460027524
No
Biotechnology Dept., Pasteur Institute of Iran, Tehran, Iran
بخش بیوتکنولوژی، انستیتیو پاستور ایران ، تهران، ایران
syedmahmood
eshaghhoseini
سید محمود
اسحاق حسینی
4700319475328460027525
4700319475328460027525
No
Amir Alam Hospital, Tehran, Iran
بخش اندوسکوپی، بیمارستان امیر اعلم تهران، تهران، ایران
akbar
oghalai
اکبر
عقلایی
4700319475328460027526
4700319475328460027526
No
Biotechnology Dept., Pasteur Institute of Iran, Tehran, Iran
بخش بیوتکنولوژی، انستیتیو پاستور ایران ، تهران، ایران
fatemeh
mirkhani
فاطمه
میرخانی
4700319475328460027527
4700319475328460027527
No
Biochemistry Dept., Pasteur Institute of Iran, Tehran, Iran
بخش بیوشیمی، انستیتیو پاستور ایران ، تهران، ایران
Zahra
Zamani
زهرا
زمانی
zamani@pasteur.ac.ir
4700319475328460027528
4700319475328460027528
Yes
Biochemistry Dept., Pasteur Institute of Iran, Tehran, Iran
بخش بیوشیمی، انستیتیو پاستور ایران ، تهران، ایران