TY - JOUR T1 - Investigation of protein network of proteins in cardiovascular disease TT - بررسی شبکه پروتئینی پروتئین‌‌های دخیل در بیماری قلبی-عروقی JF - Koomesh JO - Koomesh VL - 19 IS - 4 UR - http://koomeshjournal.semums.ac.ir/article-1-3490-fa.html Y1 - 1396 SP - 785 EP - 791 KW - Protein Interaction Mapping KW - Cardiovascular Disease KW - Gene Ontology N2 - هدف: بیماری قلبی- عروقی (Cardiovascular disease) که قلب و رگ‌های قلبی را شامل می‌شود،    جزء شایع‌ترین علل مرگ‌ها در جهان است و متاسفانه محدودیت در تشخیص زودرس بیماری وجود دارد. در این مطالعه، شبکه پروتئینی به منظورکشف بیومارکرهای اختصاصی برای تشخیص زودرس بیماری و معالجه به موقع  بررسی گردید. مواد و روش‌ها: در این مطالعه، پروتئین‌های دخیل در بیماری قلبی-عروقی با استفاده از پایگاه‌های داده Polysearch, OMIM و Wiki pathway جمع‌آوری و سپس این پروتئین‌ها روی شبکه برهمکنش پروتئین-پروتئین منطبق شدند. آنالیز توپولوژیکی زیرشبکه توسط نرم‌افزار 3‌.3 Cytoscape انجام شد. پارامترهای درجه راس و betweenness برای معرفی مارکرهای کاندید در نظر گرفته شدند. یافته‌ها: پس از آنالیز توپولوژیکی شبکه، پروتئین‌های با درجه راس بالا به عنوان hub و پروتئین‌های با betweenness بالا به عنوان bottleneck شناخته شدند. 3 پروتئین hub-bottleneck که مرکزیت بالا در شبکه داشتند، به عنوان مارکرهای کاندید معرفی شدند. نتیجه‌گیری: کاندیداهای پروتئینی برای بیماری قلبی- عروقی IL6, MMP9 و AKT1 معرفی شدند که می‌توانند بیومارکرهای تشخیصی و یا اهداف دارویی برای این بیماری باشند. علاوه بر این، مسیرهای بیوشیمیایی برای پروتئین‌های زیر شبکه با بالاترین امتیاز شامل تنظیم منفی انتقال یون، سنتز کلاژن، تخریب پلاکت و فروپاشی ماتریکس خارج سلولی می‌باشد. M3 ER -