آنالیز شبکه برهمکنش پروتئین - پروتئین بر اساس ژنهای تغییر بیان یافته در مایع مغزی نخاعی برای بیماری مالتیپل اسکلروزیس
|
ناهید صفری علی قیارلو ، مصطفی رضایی طاویرانی ، محمد تقی زاده ، سید محمد طباطبائی ، سعید نمکی |
|
|
چکیده: (4846 مشاهده) |
هدف: ام.اس شایعترین بیماری تخریب میلین سیستم عصبی مرکزی است. روشهای جدید، برای فهم بهتر بیماریزایی و معرفی اهداف دارویی جدید ضروری میباشند. هدف این مطالعه، استفاده از روش شبکه زیستی به منظور شناسایی نشانگرهای کلیدی جدید درگیر در بیماریزایی ام.اس بود.
مواد و روشها: در این مطالعه، پروفایل بیان ژن مایع مغزی نخاعی مربوط به 26 بیمار تازه مبتلا شده به ام.اس و 18 فرد کنترل از پایگاه داده Array Express گرفته و آنالیز شد. ژنهای متفاوت بیان شده با دادههای برهمکنش پروتئین-پروتئین تلفیق و زیرشبکه برهمکنش پروتئین- پروتئین ساخته شد. ویژگیهای توپولوژیکی شبکه حاصل توسط نرمافزار cytoscape مورد آنالیز قرار گرفت.
یافتهها: با آنالیز پروفایل بیان ژن، 3062 ژن متفاوت بیان شده (0/05FDR |
|
واژههای کلیدی: : ام.اس، پروفایل بیان ژن، نقشههای برهمکنش پروتئین-پروتئین، ویژگیهای توپولوژیکی |
|
متن کامل [PDF 767 kb]
(1202 دریافت)
|
نوع مطالعه: پژوهشي |
موضوع مقاله:
عمومى دریافت: 1395/8/4 | پذیرش: 1396/8/6 | انتشار: 1396/10/11
|
|
|
|