|
بررسی شبکه پروتئینی پروتئینهای دخیل در بیماری قلبی-عروقی
|
اکرم صفایی   ، مصطفی رضایی-طاویرانی ، مونا زمانیان-عضدی |
|
|
|
چکیده: (4625 مشاهده) |
| هدف: بیماری قلبی- عروقی (Cardiovascular disease) که قلب و رگ‌های قلبی را شامل می‌شود، جزء شایع‌ترین علل مرگ‌ها در جهان است و متاسفانه محدودیت در تشخیص زودرس بیماری وجود دارد. در این مطالعه، شبکه پروتئینی به منظورکشف بیومارکرهای اختصاصی برای تشخیص زودرس بیماری و معالجه به موقع بررسی گردید.
مواد و روش‌ها: در این مطالعه، پروتئینهای دخیل در بیماری قلبی-عروقی با استفاده از پایگاه‌های داده Polysearch, OMIM و Wiki pathway جمع‌آوری و سپس این پروتئین‌ها روی شبکه برهمکنش پروتئین-پروتئین منطبق شدند. آنالیز توپولوژیکی زیرشبکه توسط نرم‌افزار 3.3 Cytoscape انجام شد. پارامترهای درجه راس و betweenness برای معرفی مارکرهای کاندید در نظر گرفته شدند.
یافته‌ها: پس از آنالیز توپولوژیکی شبکه، پروتئینهای با درجه راس بالا به عنوان hub و پروتئینهای با betweenness بالا به عنوان bottleneck شناخته شدند. 3 پروتئین hub-bottleneck که مرکزیت بالا در شبکه داشتند، به عنوان مارکرهای کاندید معرفی شدند.
نتیجه‌گیری: کاندیداهای پروتئینی برای بیماری قلبی- عروقی IL6, MMP9 و AKT1 معرفی شدند که می‌توانند بیومارکرهای تشخیصی و یا اهداف دارویی برای این بیماری باشند. علاوه بر این، مسیرهای بیوشیمیایی برای پروتئینهای زیر شبکه با بالاترین امتیاز شامل تنظیم منفی انتقال یون، سنتز کلاژن، تخریب پلاکت و فروپاشی ماتریکس خارج سلولی می‌باشد. |
|
| واژه‌های کلیدی: نقشه تعامل پروتئینی، بیماری قلبی عروقی، ژن آنتولوژی |
|
|
متن کامل [PDF 670 kb]
(993 دریافت)
|
نوع مطالعه: پژوهشي |
موضوع مقاله:
عمومى
دریافت: 1395/5/28 | پذیرش: 1396/5/14 | انتشار: 1396/7/10
|
|
|
|
|
|
