[صفحه اصلی ]   [Archive] [ English ]  
:: صفحه اصلي :: درباره نشريه :: آخرين شماره :: تمام شماره‌ها :: جستجو :: ثبت نام :: ارسال مقاله :: تماس با ما ::
:: جلد 19، شماره 4 - ( (پياپی 68)، پائیز 1396 ) ::
جلد 19 شماره 4 صفحات 785-791 برگشت به فهرست نسخه ها
بررسی شبکه پروتئینی پروتئین‌‌های دخیل در بیماری قلبی-عروقی
اکرم صفایی، مصطفی رضایی-طاویرانی* ، مونا زمانیان-عضدی
چکیده:   (808 مشاهده)
هدف: بیماری قلبی- عروقی (Cardiovascular disease) که قلب و رگ‌های قلبی را شامل می‌شود،    جزء شایع‌ترین علل مرگ‌ها در جهان است و متاسفانه محدودیت در تشخیص زودرس بیماری وجود دارد. در این مطالعه، شبکه پروتئینی به منظورکشف بیومارکرهای اختصاصی برای تشخیص زودرس بیماری و معالجه به موقع  بررسی گردید.
مواد و روش‌ها: در این مطالعه، پروتئین‌های دخیل در بیماری قلبی-عروقی با استفاده از پایگاه‌های داده Polysearch, OMIM و Wiki pathway جمع‌آوری و سپس این پروتئین‌ها روی شبکه برهمکنش پروتئین-پروتئین منطبق شدند. آنالیز توپولوژیکی زیرشبکه توسط نرم‌افزار 3‌.3 Cytoscape انجام شد. پارامترهای درجه راس و betweenness برای معرفی مارکرهای کاندید در نظر گرفته شدند.
یافته‌ها: پس از آنالیز توپولوژیکی شبکه، پروتئین‌های با درجه راس بالا به عنوان hub و پروتئین‌های با betweenness بالا به عنوان bottleneck شناخته شدند. 3 پروتئین hub-bottleneck که مرکزیت بالا در شبکه داشتند، به عنوان مارکرهای کاندید معرفی شدند.
نتیجه‌گیری: کاندیداهای پروتئینی برای بیماری قلبی- عروقی IL6, MMP9 و AKT1 معرفی شدند که می‌توانند بیومارکرهای تشخیصی و یا اهداف دارویی برای این بیماری باشند. علاوه بر این، مسیرهای بیوشیمیایی برای پروتئین‌های زیر شبکه با بالاترین امتیاز شامل تنظیم منفی انتقال یون، سنتز کلاژن، تخریب پلاکت و فروپاشی ماتریکس خارج سلولی می‌باشد.
واژه‌های کلیدی: نقشه تعامل پروتئینی، بیماری قلبی عروقی، ژن آنتولوژی
متن کامل [PDF 670 kb]   (137 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشي | موضوع مقاله: عمومى
دریافت: ۱۳۹۵/۵/۲۸ | پذیرش: ۱۳۹۶/۵/۱۴ | انتشار: ۱۳۹۶/۷/۱۰
ارسال پیام به نویسنده مسئول

ارسال نظر درباره این مقاله
نام کاربری یا پست الکترونیک شما:

CAPTCHA code


XML   English Abstract   Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Safaei A, rezaei tavirani M, Zamanian Azodi M. Investigation of protein network of proteins in cardiovascular disease. koomesh. 2017; 19 (4) :785-791
URL: http://koomeshjournal.semums.ac.ir/article-1-3490-fa.html

صفایی اکرم، رضایی-طاویرانی مصطفی، زمانیان-عضدی مونا. بررسی شبکه پروتئینی پروتئین‌‌های دخیل در بیماری قلبی-عروقی. كومش. 1396; 19 (4) :785-791

URL: http://koomeshjournal.semums.ac.ir/article-1-3490-fa.html



جلد 19، شماره 4 - ( (پياپی 68)، پائیز 1396 ) برگشت به فهرست نسخه ها
کومش Koomesh
Persian site map - English site map - Created in 0.05 seconds with 31 queries by YEKTAWEB 3731