اکثر مکاتبات کومش از طریق ایمیل سایت می باشد. لطفا Spam ایمیل خود را نیز چک نمایید.
   [صفحه اصلی ]   [Archive] [ English ]  
:: ::
بخش‌های اصلی
صفحه اصلی::
اطلاعات نشریه::
آرشیو مجله و مقالات::
برای نویسندگان::
برای داوران::
ثبت نام و اشتراک::
کار آزمایی بالینی::
تماس با ما::
تسهیلات پایگاه::
::
هزینه چاپ مقاله در کومش
با توجه به تصمیمات گرفته شده جهت پذیرش مقالات در مجله کومش از نویسندگان مقاله هزینه دریافت می گردد. هزینه پذیرش مقالات از ابتدای سال 1402 در مجله کومش  مبلغ 12.000.000ریال (یک میلیون و دویست هزار تومان) می باشد. که نویسنده مسئول می بایست جهت دریافت نامه پذیرش به حساب درآمد های دانشگاه واریز نمایند تا گواهی پذیرش مقاله صادر و مراحل بعدی انتشار مقاله انجام شود.
تبصره: این مصوبه شامل مقالاتی که نویسنده مسئول مقاله از همکاران دانشگاه علوم پزشکی سمنان باشد نمی شود.
..
لیست داوران پیشنهادی
..
جستجو در پایگاه

جستجوی پیشرفته
..
دریافت اطلاعات پایگاه
نشانی پست الکترونیک خود را برای دریافت اطلاعات و اخبار پایگاه، در کادر زیر وارد کنید.
..
Google Scholar Metrics

Citation Indices from GS

AllSince 2019
Citations87484258
h-index3821
i10-index272121

..
:: جلد 22، شماره 4 - ( پائیز 1399 ) ::
جلد 22 شماره 4 صفحات 649-644 برگشت به فهرست نسخه ها
کاربرد الگوریتم تعدیل‌یافته BIRCH در ناحیه‌بندی عملکرد مغز بر اساس داده‌های fMRI
نوید ولی زاده ، سهیلا خداکریم ، سیدمحمد طباطبایی ، اعظم صفار ، علیرضا اکبرزاده باغبان
چکیده:   (2458 مشاهده)
هدف: خوشه‌بندی نواحی مغز در تشخیص، درمان و پیگیری بیماری تومور مغزی بسیار مفید است. روش‌های مختلفی برای خوشه‌بندی نواحی مغز وجود دارد. در این مقاله الگوریتم جدیدی تحت عنوان Balanced Iterative Reducing and Clustering using Hierarchies (BIRCH) تعدیل‌یافته برای ناحیه‌بندی مغز معرفی می‌شود که دارای دقت و سرعت بالایی در خوشه‌بندی مغز است. مواد و روش‌ها: در این پژوهش از داده‌های اسکن مغزی به عنوان معرفی از عملکرد نواحی مختلف مغز استفاده شد. این داده‌ها شامل 74 اسکن مغزی متوالی بود. خوشه‌بندی نواحی مورد نظر با الگوریتم‌های BIRCH معمولی و BIRCH تعدیل یافته با استفاده از ابزار WFU-PickAtlas نرم‌افزار Matlab انجام شد و نتایج با اطلس استاندارد TD Lobes مقایسه شد. یافته‌ها: الگوریتم‌ BIRCH تعدیل‌یافته در مواجهه با داده‌های بسیار حجیمی مانند داده‌های اسکن مغزی نسبت به الگوریتم BIRCH معمول دارای مزیت نسبی بود و با افزایش حدآستانه‌ای سرعت اجرای الگوریتم کاهش یافت. در این الگوریتم، الگوی صعودی یا نزولی خاصی بین فاکتور شاخه‌بندی و زمان اجرای الگوریتم دیده نشد. ماکزیمم مقدار زمان اجرای الگوریتم مربوط به فاکتور شاخه‌بندی 30، برابر 94 ثانیه بود که هم ارز حد آستانه‌ بالای الگوریتم BIRCH معمولی بود. نتیجه‌گیری: الگوریتم‌ BIRCH تعدیل یافته می‌تواند تعادلی بین پیچیدگی زمانی و مکانی برقرار ‌کند و نیاز به حافظه کامپیوتری کمی در اجرای خوشه‌بندی دارد. هم‌چنین با افزایش هم‌زمان فاکتور شاخه‌بندی و حدآستانه‌ای میزان حساسیت در خوشه‌بندی آن کاهش یافت و بنابراین انتظار می‌رود درداده مورد مطالعه و اکسل‌هایی با شباهت کم‌تر در یک خوشه قرار گرفته باشند.  
واژه‌های کلیدی: مغز، تحلیل خوشه‌ای، الگوریتمها، تصویربرداری از طریق تشدید مغناطیسی
متن کامل [PDF 900 kb]   (584 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشي | موضوع مقاله: عمومى
دریافت: 1398/7/10 | پذیرش: 1399/3/17 | انتشار: 1399/7/9
فهرست منابع
1. [1] Selvy P, Palanisamy V, Purusothaman T. Performance analysis of clustering algorithms in brain tumor detection of MR images. Eur J Sci Res 2011; 62: 321-330.
2. [2] Saha M, Panda C. A review on various image segmentation techniques for brain tumor detection. Int Confer Electron Commun Aerospace Technol 2018.
3. [3] Mayer AR, Bellgowan PS, Hanlon FM. Functional magnetic resonance imaging of mild traumatic brain injury. Neurosci Biobehav Rev 2015; 49: 8-18. [DOI:10.1016/j.neubiorev.2014.11.016] [PMID]
4. [4] Anuradha R, Sushila R, Pranav M. Performance analysis of K-means and CLARANS clustering algorithm. Int J Manag Technol Engin 2018; 8: 374-378.
5. [5] Filler A. The history, development and impact of computed imaging in neurological diagnosis and neurosurgery: CT, MRI, and DTI. Int J Neurosurg 2010; 7: 5-35. [DOI:10.5580/23c6]
6. [6] Lindquist M. The statistical analysis of fMRI data. Stat Sci 2008; 23: 439-464. [DOI:10.1214/09-STS282]
7. [7] Kantardzic M. Data mining: concepts, models, methods, and algorithms. John Wiley & Sons 2011. [DOI:10.1002/9781118029145] [PMID]
8. [8] Zhang T, Ramakrishnan R, Livny M. BIRCH: an efficient data clustering method for very large databases. ACM Sigmod Record 1996. [DOI:10.1145/233269.233324]
9. [9] Madan S, Dana KJ. Modified balanced iterative reducing and clustering using hierarchies (m-BIRCH) for visual clustering. Pattern Anal Appl 2016; 19: 1023-1040. [DOI:10.1007/s10044-015-0472-4]
10. [10] www.nitrc.org. last visit: 15 May 2019.
11. [11] Windischberger C, Barth M, Lamm C, Schroeder L, Bauer H, Gur RC, Moser E. Fuzzy cluster analysis of high-field functional MRI data. Artif Intell Med 2003; 29: 203-223. [DOI:10.1016/S0933-3657(02)00072-6]
12. [12] Heller R, Stanley D, Yekutieli D, Benjamini Y. Cluster-based analysis of FMRI data. NeuroImage 2006; 33: 599-608. [DOI:10.1016/j.neuroimage.2006.04.233] [PMID]
13. [13] Bednarik L, Kovacs L. Efficiency analysis of quality threshold clustering algorithms. Produc Syst Inform Engin 2013; 6: 15-26.
14. [14] Woo CW, Krishnan A, Wager TD. Cluster-extent based thresholding in fMRI analyses: pitfalls and recommendations. Neuroimage 2014; 91: 412-419. [DOI:10.1016/j.neuroimage.2013.12.058] [PMID] [PMCID]
15. [15] Borumandnia N, Alavi Majd H, Zayeri F, Baghestani A R, Faeghi F, Tabatabaei SM. Bayesian spatiotemporal model for detecting of active areas in brain for analyzing of fMRI data. Koomesh 2017; 19: 845-851. (Persian).
16. [16] zolghadr Z, Alavi Majd H, Faeghi F, Niaghi F, Hajizadeh N. Classification of brain stem glioma tumor grade based on MRI findings using support vector machine. Koomesh 2017; 19: 584-590. (Persian).
17. [1] Selvy P, Palanisamy V, Purusothaman T. Performance analysis of clustering algorithms in brain tumor detection of MR images. Eur J Sci Res 2011; 62: 321-330.
18. [2] Saha M, Panda C. A review on various image segmentation techniques for brain tumor detection. Int Confer Electron Commun Aerospace Technol 2018.
19. [3] Mayer AR, Bellgowan PS, Hanlon FM. Functional magnetic resonance imaging of mild traumatic brain injury. Neurosci Biobehav Rev 2015; 49: 8-18. [DOI:10.1016/j.neubiorev.2014.11.016] [PMID]
20. [4] Anuradha R, Sushila R, Pranav M. Performance analysis of K-means and CLARANS clustering algorithm. Int J Manag Technol Engin 2018; 8: 374-378.
21. [5] Filler A. The history, development and impact of computed imaging in neurological diagnosis and neurosurgery: CT, MRI, and DTI. Int J Neurosurg 2010; 7: 5-35. [DOI:10.5580/23c6]
22. [6] Lindquist M. The statistical analysis of fMRI data. Stat Sci 2008; 23: 439-464. [DOI:10.1214/09-STS282]
23. [7] Kantardzic M. Data mining: concepts, models, methods, and algorithms. John Wiley & Sons 2011. [DOI:10.1002/9781118029145] [PMID]
24. [8] Zhang T, Ramakrishnan R, Livny M. BIRCH: an efficient data clustering method for very large databases. ACM Sigmod Record 1996. [DOI:10.1145/233269.233324]
25. [9] Madan S, Dana KJ. Modified balanced iterative reducing and clustering using hierarchies (m-BIRCH) for visual clustering. Pattern Anal Appl 2016; 19: 1023-1040. [DOI:10.1007/s10044-015-0472-4]
26. [10] www.nitrc.org. last visit: 15 May 2019.
27. [11] Windischberger C, Barth M, Lamm C, Schroeder L, Bauer H, Gur RC, Moser E. Fuzzy cluster analysis of high-field functional MRI data. Artif Intell Med 2003; 29: 203-223. [DOI:10.1016/S0933-3657(02)00072-6]
28. [12] Heller R, Stanley D, Yekutieli D, Benjamini Y. Cluster-based analysis of FMRI data. NeuroImage 2006; 33: 599-608. [DOI:10.1016/j.neuroimage.2006.04.233] [PMID]
29. [13] Bednarik L, Kovacs L. Efficiency analysis of quality threshold clustering algorithms. Produc Syst Inform Engin 2013; 6: 15-26.
30. [14] Woo CW, Krishnan A, Wager TD. Cluster-extent based thresholding in fMRI analyses: pitfalls and recommendations. Neuroimage 2014; 91: 412-419. [DOI:10.1016/j.neuroimage.2013.12.058] [PMID] [PMCID]
31. [15] Borumandnia N, Alavi Majd H, Zayeri F, Baghestani A R, Faeghi F, Tabatabaei SM. Bayesian spatiotemporal model for detecting of active areas in brain for analyzing of fMRI data. Koomesh 2017; 19: 845-851. (Persian).
32. [16] zolghadr Z, Alavi Majd H, Faeghi F, Niaghi F, Hajizadeh N. Classification of brain stem glioma tumor grade based on MRI findings using support vector machine. Koomesh 2017; 19: 584-590. (Persian).
ارسال پیام به نویسنده مسئول

ارسال نظر درباره این مقاله
نام کاربری یا پست الکترونیک شما:

CAPTCHA



XML   English Abstract   Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Valizadeh N, Khodakarim S, Tabatabaei S M, Saffar A, Akbarzadeh Baghban A. Application of modified balanced iterative reducing and clustering using hierarchies algorithm in parceling of brain performance using fMRI data. Koomesh 1399; 22 (4) :644-649
URL: http://koomeshjournal.semums.ac.ir/article-1-5966-fa.html

ولی زاده نوید، خداکریم سهیلا، طباطبایی سیدمحمد، صفار اعظم، اکبرزاده باغبان علیرضا. کاربرد الگوریتم تعدیل‌یافته BIRCH در ناحیه‌بندی عملکرد مغز بر اساس داده‌های fMRI. كومش. 1399; 22 (4) :644-649

URL: http://koomeshjournal.semums.ac.ir/article-1-5966-fa.html



بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.
جلد 22، شماره 4 - ( پائیز 1399 ) برگشت به فهرست نسخه ها
کومش Koomesh
Persian site map - English site map - Created in 0.13 seconds with 42 queries by YEKTAWEB 4645